PROTEOMICS WORKFLOWS

蛋白组学

围绕蛋白制备、定量、分离与功能分析,建立从样本到机制证据的可追踪路径。

索取流程与产品建议

WORKFLOW MAP

从样本到证据

01

蛋白制备

从裂解、澄清、还原烷基化到酶解,保持蛋白和肽段质量。

  1. 样本采集与低温保存
  2. 裂解与去除杂质
  3. 还原、烷基化和酶解
  4. 肽段脱盐与浓缩

风险降解、盐和去污剂残留、批次差异与低输入损失。

QC蛋白浓度、肽段回收率、空白和批次记录。

02

定量分析

选择 label-free、TMT 或 DIA 等策略,控制缺失值、批次和定量偏差。

  1. 实验设计与随机化
  2. 内标或通道规划
  3. 质谱采集与校准
  4. 归一化和缺失值审查

风险离子抑制、批次漂移、通道串扰和统计功效不足。

QC内标、鉴定数、CV、缺失率、FDR 和批间漂移。

03

分离分析

用 LC、离子淌度和分级策略改善复杂样本的峰容量与覆盖度。

  1. 色谱和梯度选择
  2. 分级或富集
  3. DDA/DIA 方法设置
  4. 系统适用性评估

风险保留时间漂移、峰重叠、污染和仪器状态变化。

QC保留时间、峰面积、压力、空白和系统适用性样本。

04

功能分析

将差异蛋白、修饰、通路和靶点证据连接到细胞或疾病表型。

  1. 差异与富集分析
  2. 通路和网络解释
  3. 候选功能验证
  4. 结果可复现记录

风险数据库版本、过度解释、批次混杂和缺少正交验证。

QC参考库版本、FDR、效应量、重复和正交实验。

RESEARCH UPDATES

研究进展与流程证据

uMetaP:超高灵敏度宏蛋白组学

结合高灵敏度 LC-MS 和经 FDR 验证的从头测序,扩大低丰度微生物与宿主蛋白的检测范围。

Nature Communications